このブログでは、生物の分類やその系統に関連する用語を使うことが多いです。 これらの用語は難しいので、この記事では、このトピックに入門する人のために説明します。

本題に入る前に、混同されがちな2つの概念、「系統」と「分類」について説明する必要があります。

系統学とは、分類と系統の再構築の科学であり、分類群（種、科、目などの分類したい単位）の起源と多様性を再構築する責任があることを意味しています。

一方、分類学とは、科学的な分類の原理、生物の目や名前を研究する学問です。

つまり、系統学が木に代表される分類のシステムを作る役割を担っているのに対し、分類学は系統学に基づいて、各種をそれぞれの分類カテゴリーに同定・命名・分類するためのルールや方法を確立するものです。

ABOUT SPECIES AND BEYOND

種とは何か、生物の他の分類レベルを知らずして、種の分類方法を語り始めることはできません。

種とは何か

歴史上、種という概念には異なるアプローチでいくつかの定義が与えられてきました。

• 形態学的な種の概念：種とは、パターンや原型を表す固定的で本質的な特徴を持つ生物のグループです。

• 生物学的な種の概念：種とは、自分たちの間で繁殖し、生殖的に隔離された、自然界で独自のニッチを持つ自然の個体群のグループです。 つまり、種は共通の祖先を持ち、段階的に変化する形質を共有しています。
• 種の進化論的概念：種とは、他の系統の前でアイデンティティを維持し、その進化の傾向と歴史的な目的地を持つ、祖先と子孫の集団の単一の系統である。
• 系統的な種の概念：この観点によると、種とは、他の類似したグループから診断上区別され、その内部に祖先と子孫の親パターンが存在する、不可解な生物のグループです。

BEYOND SPECIES

種は、より多くの分類学的カテゴリーに基づいた階層的なシステムに分類されます。 最高位から最低位のカテゴリーまで、生物は分類されます。 Domain> Kingdom> Phylum> Class> Order>。 Family> Genus> Species> Subspecies> Variety> Form.

例として、犬を想像してみましょう。 犬もオオカミと同様に同じ種に含まれます。 犬はCanis lupusですが、犬はCanis lupus familiarisという亜種です。 種の命名は、その属（Canis）の後に特定のエピテット（lupus）が続きます。 犬の他の分類学上のカテゴリーは

HOW IS TREE OF LIFE RECONSTRUCTED?

生きている種と絶滅した種の関係（系統）である生命の木を再構築するためには、形質を利用します。

系統樹を再構築するためには、異なる分類群の間で共有される形質を利用します。

形質の類似性には2つのタイプがあり、共通の系統の結果として形質が類似している場合をホモロジーと呼び、共通の祖先の結果ではない場合をホモプラシーと呼びます。

例を挙げると理解しやすいでしょう。

ホモプラシーには3つのタイプがあります：

• 並列性。 可変形質の祖先的な状態（plesiomorphic）は共通祖先に存在するが、派生的な状態（apomorphic）は独立して進化したもの。 例としては、鳥類や哺乳類の4つの空洞を持つ心臓の発達が挙げられます。
• 収束：この場合、ホモプラティックな形質は共通の祖先には存在しません。 収束によって生まれた構造をアナロジーと呼びます。
• 二次消失または復帰：形質が祖先のような状態に戻ることで構成されます。

生物を秩序立てるために用いられる形質には、形態学的、構造学的、発生学的、古生物学的、倫理学的、生態学的、生化学的、分子学的などの種類があります。

ある形質の派生状態を共有する種はクレードを構成し、その形質はシナポモルフィーと呼ばれます。 シナポモルフィーとは、共通の祖先に由来し、その祖先とその子孫のすべてに存在する形質のことです。

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形質を選択した後、いくつかの分類派は、生物間の最適な関係を得るためにそれらを異なる方法で使用しています。