In 1994 keerde McQueen terug naar Londen en haalde hij een masterdiploma aan het Central Saint Martins College. Het was het keerpunt dat hem tot ontwerper bracht. McQueen werkte van 1996 tot 2001 bij Givenchy als hoofdontwerper. Na zijn scheiding met Givenchy richtte hij zich op zijn eigen label. In 2001 debuteerde hij in Parijs met de collectie The Dance of the Twisted Bull, die enkele schandalen veroorzaakte.

In 2001 kreeg “Gucci” Group 51% aandelen van het merk Alexander McQueen, dat naar McQueen werd vernoemd, en werd zijn nieuwe partner. Na verloop van tijd lanceerde McQueen “McQ” als tweede merk, en “My Queen” als parfummerk. McQueen had ook verschillende merk- en ontwerpsamenwerkingen met Puma, Samsonite en Chivas Regal. Tegen het einde van 2006 heeft het merk Alexander McQueen zijn intrede gedaan in 25 steden, waaronder Londen, Parijs, New York City, Boston, Milaan, Moskou, Tokio en Seoul.

In 1996 werd hij genomineerd als jongste Britse modeontwerper van het jaar, en opnieuw in 1997, 2001 en 2003. Bovendien werd hij in 2003 genomineerd door de Council of Fashion Designers of America (CFDA) en ontving hij ‘Commander of the Order of the British Empire’ van de koningin. Vanaf het midden van de jaren 1990 tot 2000 had hij succes in zijn carrière.