Posted on May 11, 2017 by Julian R. Marchesi

Een microbioom is de gemeenschap van micro-organismen die samenleven in een bepaalde habitat. Mensen, dieren en planten hebben hun eigen unieke microbiomen, maar dat geldt ook voor bodems, oceanen en zelfs gebouwen. Bekijk onze korte animatie voor meer informatie.

De microbiomen van dingen

“Maar hoe komt het dat we nu ineens zo enthousiast zijn over onderzoek naar microbiomen en wat ze doen? Een van de eenvoudigste verklaringen is dat we nu de instrumenten hebben waarmee we op verschillende omische niveaus, bijvoorbeeld genomen, transciptomen en metabomen, een heel microbioom en zijn microbiota en metagenoom kunnen vastleggen. Wij kunnen een systeem over de tijd en over meerdere monsters heen bekijken en voor het eerst bepalen wie daar is en wat zij mogelijkerwijs doen, en wat wij hebben gevonden is verbluffend. We zijn nu in staat om vanuit een holistische in plaats van een reductionistische benadering te proberen te verklaren hoe verschillende microbiomen betrokken zijn bij het functioneren van ecosystemen en biosystemen.

Een van de kenmerken van microbioomonderzoek is dat het gebaseerd is op een multidisciplinair onderzoeksmodel, in tegenstelling tot de traditionele microbiologie, waar een wetenschapper carrière kan maken door zich te richten op één enkele soort. Bij microbioomonderzoek heeft de microbioloog, vanwege de grote en complexe datasets, bijvoorbeeld biologische chemici nodig om de gegevens voor metabolietprofielen samen te stellen, en natuurkundigen om te helpen deze gegevens te interpreteren en de onderzoeksvraag te beantwoorden.

Voor het eerst kunnen we proberen de interacties tussen verschillende microben en het omringende systeem in kaart te brengen, en deze aanpak werpt een aantal uitdagende begrippen op – bijvoorbeeld: wat is zoogdierbiologie? Voorheen dachten we dat dit de interactie tussen het genoom van de gastheer en de omgeving was, maar nu moeten we ook het metagenoom van de microbiota, waarmee we zijn meegeëvolueerd, erbij betrekken.”

In het huidige nummer van Microbiology Today kunt u meer lezen over microbiomen.