La preparación del pesarattu no es difícil, pero debe hacerse con perfección para lograr el sabor deseado.
El primer paso es remojar el «pesalu» o gramo verde entero (una taza de 150 ml de gramo hace unos cuatro pesarattus medianos) en agua durante al menos cuatro horas (máximo siete horas). A continuación, se muele el gramo remojado hasta obtener una pasta suave con un par de chiles verdes, un trozo pequeño de jengibre y un poco de sal. Se añade el agua necesaria. La mezcla se deja reposar unos minutos para que el interior de los granos se hidrate por completo.
La masa se vierte en una sartén caliente. Si la preparación es meticulosa, el pesarattu empezará lentamente a ponerse crujiente por los bordes y a despegarse de la sartén. En las instalaciones de cocina profesionales, debido a las altas temperaturas de la sartén, no suele ser necesario dar la vuelta al pesarattu. En los entornos domésticos, se suele dar la vuelta al pesarattu, para que se cocine completamente.
A veces se añaden cebollas y chiles picados al pesarattu, extendiéndolos sobre la masa antes de que se convierta en una crepe; el upma se utiliza de forma similar. En algunos lugares, se añaden tanto upma como cebollas al pesarattu.