Définition

Les eubactéries, ou « vraies » bactéries, sont des micro-organismes procaryotes unicellulaires qui présentent un éventail de caractéristiques et que l’on trouve dans diverses conditions dans toutes les régions du monde. Tous les types de bactéries relèvent de ce titre, à l’exception des archéobactéries. Comme les eubactéries sont très répandues, ce groupe comprend l’un des trois domaines de la vie : Bactéries.

Aperçu

Au sein des organismes procaryotes, on distingue deux grandes divisions : Les Eubactéries et les Archaebactéries. Les Eubactéries se trouvent dans le domaine des Bactéries, tandis que les Archaebactéries se trouvent dans le domaine des Archaebactéries. Les eubactéries ont les caractéristiques typiques d’un organisme procaryote, mais elles ont également la capacité de former des spores et peuvent être des organismes pathogènes (c’est-à-dire causer des maladies chez les humains et les animaux). Les eubactéries peuvent se reproduire par fission binaire ou par bourgeonnement, et forment souvent de grandes colonies qui peuvent créer des structures extracellulaires comme des « biofilms » qui protègent la colonie de manière unique.

Caractéristiques des eubactéries

Les eubactéries, ou micro-organismes dépourvus d’un noyau membranaire défini, présentent plusieurs caractéristiques générales. En tant que procaryotes, elles ne possèdent pas d’organites liés à une membrane. La plupart des eubactéries sont entourées d’une paroi cellulaire, constituée de peptidoglycanes en chaîne réticulée. Cela donne à la paroi de la bactérie la force nécessaire pour maintenir sa forme et sa taille dans des environnements changeants. Les petites molécules peuvent diffuser à travers la paroi cellulaire, mais les molécules plus grandes et les ions ont besoin de protéines porteuses et de protéines de canal pour entrer dans la cellule.

Certaines bactéries peuvent avoir un flagelle (une structure composée de filaments de protéines qui sert à se déplacer). D’autres bactéries ont des pili, qui sont de petites projections sur toute la surface extérieure de la cellule, utilisées pour adhérer aux surfaces et transférer l’ADN. Lorsqu’un grand nombre de bactéries sont fixées à une surface et sont entourées d’un sac de polysaccharide, on parle de biofilm. Ce complexe présente une résistance antimicrobienne élevée.

Le fluide contenu par la membrane plasmique des bactéries est le cytosol. Il est composé principalement d’eau (environ 80 %), mais il a une consistance de gel car il est rempli de nutriments dissous, d’éléments du cytosquelette, d’ADN et d’autres substances. Les eubactéries possèdent bien des ribosomes – organites composés d’ARN et de protéines qui achèvent le processus de traduction des protéines.

L’ADN bactérien flotte librement dans le cytosol, bien qu’il soit concentré dans le nucléoïde. Les chromosomes bactériens sont souvent circulaires mais peuvent aussi être de forme linéaire. Cette forme est utile lorsque la bactérie se réplique. Les bactéries peuvent se reproduire asexuellement par fission binaire ou par bourgeonnement. Les bactéries qui subissent une fission binaire doivent d’abord s’allonger et dupliquer leur ADN avant de se séparer en deux nouvelles cellules de taille similaire. Le bourgeonnement se produit lorsque la cellule mère produit une petite extension de la membrane cellulaire et la remplit d’ADN dupliqué. La fission binaire produit deux cellules filles égales, tandis que le bourgeonnement produit une nouvelle petite cellule alors que la cellule mère reste assez grande.

Lors de périodes de conditions extrêmes non propices à la réplication, comme la famine, les eubactéries ont la capacité de devenir des endospores. Dans cet état, la bactérie peut tolérer des températures excessivement élevées et basses, des conditions acides et basiques, et de grandes quantités de rayonnement. Les endospores sont extrêmement difficiles à tuer. Étonnamment, elles peuvent être bouillies pendant des heures et survivre. Les endospores ne peuvent être fabriquées que par des bactéries à Gram positif. L’ADN bactérien demeure à l’intérieur de l’endospore, mais le cytosol perd de l’eau et devient extrêmement concentré. On pense que cela contribue à la protection contre les fortes chaleurs. La bactérie prend un revêtement dur composé de calcium et d’acide dipicolinique, créant une barrière dense et imprenable pour stabiliser l’ADN dans la cellule. Les enzymes de réparation de l’ADN sont également toujours actives, contribuant à la résistance de l’endospore.

Les plasmides sont également présents au sein des bactéries, séparés de l’ADN circulaire de la bactérie. Également appelés « réplicons », les plasmides sont des molécules d’ADN à réplication autonome. Essentiellement, ces petits anneaux d’ADN permettent aux bactéries de transférer des gènes entre organismes. Ces éléments permettent le transfert horizontal de gènes, qui est un moyen pour une bactérie d’acquérir de nouveaux gènes et de nouvelles caractéristiques, comme la résistance aux antibiotiques. Ils contribuent principalement à la mutation rapide des bactéries en fonction des conditions environnementales changeantes. Comme les autres matériels génétiques, les plasmides peuvent être transmis aux cellules filles lors de la réplication.

Archaebactéries vs Eubactéries

Les archaebactéries et les Eubactéries sont toutes deux procaryotes, bien que ces organismes existent dans des domaines biologiques différents car ils sont génétiquement très différents. On pense que les archibactéries sont parmi les plus anciennes formes de vie sur Terre, tandis que les eubactéries sont apparues plus tard dans l’histoire de l’évolution. Les eubactéries se retrouvent aujourd’hui dans presque tous les environnements, alors que les archaebactéries n’ont été repoussées que dans les environnements les plus extrêmes – comme les lacs à forte salinité, les sources chaudes thermiques et les profondeurs de la croûte terrestre.

Il existe quelques autres différences entre ces groupes. Par exemple, les archibactéries ne sont pas sensibles aux antibiotiques, alors que la plupart des eubactéries le sont (à moins qu’elles n’aient développé une résistance.) Les archibactéries n’infectent généralement pas les humains (ou ne participent pas à la digestion), ce qui ne pose généralement pas de problème pour la santé humaine. De plus, les eubactéries ont la capacité de former des spores pour survivre à des conditions défavorables, alors que les archibactéries n’ont pas cette capacité.

Types d’eubactéries

Les bactéries prennent communément l’une des trois formes suivantes : bacilles, cocci et spirilles. Les bacilles ont une forme de bâtonnet, les cocci une forme sphérique, et les spirilles une forme de spirale ou de vague. Leur forme était souvent utilisée comme système de classification jusqu’à ce que des études récentes sur l’ADN remettent en question ces classifications. Les bactéries peuvent rester liées après la division, formant d’autres formes telles que des amas, des filaments et des serpentins serrés.

Les eubactéries sont généralement classées en Gram positif, Gram négatif et Divers. Bien qu’il existe de nombreux phyla d’eubactéries sous le domaine Bactéries, ces relations changent souvent et sont encore définies sur la base de nouvelles expériences sur l’ADN.

Certaines bactéries possèdent une couche supplémentaire entourant la paroi cellulaire appelée membrane externe bactérienne. Cette couche supplémentaire ne peut pas être colorée avec une coloration de Gram qui est souvent utilisée pour classer les bactéries par les chercheurs. C’est pourquoi on les appelle des bactéries « Gram-négatives » ou des bactéries « Gram-positives » qui peuvent être vues avec une coloration de Gram. Généralement, les bactéries Gram-négatives contiennent plus d’espèces pathogènes pour l’homme, alors que les bactéries Gram-positives sont bénéfiques ou non pour la santé humaine.

Exemples d’Eubactéries

Escherichia coli, abrégé en E. coli, appartient au domaine des Eubactéries. Elle est classée dans l’embranchement des Proteobacteria. Elle est en forme de bâtonnet et Gram-négatif, elle possède donc une membrane supplémentaire entourant sa paroi cellulaire. E. coli est communément présent dans l’intestin de nombreux types d’hôtes à sang chaud, y compris les humains, mais il peut devenir pathogène dans les bonnes conditions. La plupart des souches sont inoffensives (et peut-être bénéfiques), mais certaines peuvent provoquer des intoxications alimentaires et d’autres maladies. La bactérie ne peut survivre en dehors d’un hôte que pendant un temps limité.

Streptococcus pneumoniae, abrégé en S. pneumoniae est une autre eubactérie commune. Elle appartient à l’embranchement des Firmicutes. Elle a une forme sphérique et est Gram-positive. On peut trouver S. pneumoniae sur des hôtes sains dans les voies respiratoires, la cavité nasale et les sinus. Cependant, la bactérie peut devenir pathogène et se propager à d’autres parties du corps, provoquant souvent une pneumonie et une méningite chez les hôtes immunodéprimés. En grande quantité, la bactérie peut également provoquer d’autres maladies, notamment, mais sans s’y limiter, des bronchites, des sinusites aiguës et des septicémies.

Ces deux exemples montrent comment la classification Gram positif vs Gram négatif des bactéries pathogènes peut être trompeuse. De nombreuses espèces de bactéries peuvent être utiles ou nuisibles dans différentes conditions.

Quiz

1. Quel phylum n’est pas inclus dans les Eubactéries ?
A. Les chlamydias
B. Les algues bleu-vert
C. Les protéobactéries
D. Archaebactéries

2. Qu’est-ce qui n’est PAS une forme commune que prennent les bactéries ?
A. Spirilles
B. Cocci
C. Bacilles
D. Squamous

3. Comment les eubactéries prolifèrent-elles ?
A. Fission binaire
B. Bourgeonnement
C. Toutes ces réponses
D. Aucune de ces réponses