Całościowe badanie fizykalne jest wykonywane przez lekarza poszukującego wszelkich oznak choroby lub możliwych do leczenia warunków medycznych. Kolejność wykonywania poszczególnych czynności będzie się różnić w zależności od lekarza. Historia medyczna jest zazwyczaj wykonywana w pierwszej kolejności, patrząc na wszelkie historie medyczne, które będą badane dalej w trakcie badania. Dokładne procedury będą zależeć od każdego pacjenta i indywidualnych preferencji lekarza.

Pierwszy, wzrost i waga są mierzone. Lekarz zmierzy również temperaturę i ciśnienie krwi, a także tętno. Zbadane zostaną również nos, uszy i gardło. Lekarz obejrzy także szyję i pachy w poszukiwaniu obrzękniętych węzłów chłonnych, które są oznaką infekcji. W tym czasie badana jest również tarczyca, czy nie ma żadnych mas, tkliwości lub powiększenia. Lekarz krótko zbada skórę, głowę, oczy i plecy pod kątem jakichkolwiek nieprawidłowości.

Serce jest również słuchane podczas egzaminu za pomocą stetoskopu, który słucha wewnętrznego oddechu i rytmu. Lekarz może również ocenić brzuch, narządy rozrodcze, nogi i naczynia krwionośne. Po przeprowadzeniu różnych testów, lekarz może zlecić różne badania laboratoryjne w celu sprawdzenia, czy pacjent ma jakiekolwiek obawy.