3.3.2.6 Heterocykle azotowe
Puryny i pirymidyny, takie jak nukleobazy adenina, guanina, cytozyna, tymina i uracyl, są małymi, zawierającymi azot aromatycznymi strukturami pierścieniowymi (N-heterocykle) i są kluczowe dla biologii lądowej. W biochemii nukleobazy służą jako monomery informacyjne kwasu rybonukleinowego (RNA) i kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) bez grup cukrowych i fosforanowych, są wszechobecne i stare, o czym świadczy ich znacząca rola w koenzymach i szlakach biochemicznych (Bloch, 1996). Adenina i guanina występują w RNA i DNA w życiu lądowym, podczas gdy tymina występuje tylko w DNA, a uracyl tylko w RNA. Dostępność nukleobaz jako substratów dla chemii prebiotycznej prowadzącej do powstania pierwszych samoreplikujących się systemów wczesnej Ziemi zależy od ich endogennej syntezy oraz od ich dostarczenia przez źródła egzogenne. Aby określić, czy materiał egzogeniczny był ważnym źródłem puryn i pirymidyn na prebiotycznej Ziemi, zbadano skład nukleobaz w CCs.
Pochodzenie nukleobaz w chondrytach jest przedmiotem dyskusji od wczesnych lat 60-tych, kiedy to opublikowano pierwsze doniesienia o obecności zasad purynowych i pirymidynowych w ekstraktach meteorytów węglowych (np. Briggs, 1961). Briggs, 1961). Kilka grup później wykryło obecność puryn i pirymidyn w CCs (Folsome i in., 1971; Hayatsu, 1964; Hayatsu i in., 1975; Stoks i Schwartz, 1979, 1981; Van der Velden i Schwartz, 1977). Jednakże później wykazano, że niektóre z zastosowanych technik analitycznych zanieczyściły próbki lub spowodowały artefakty, w szczególności fałszywe wykrycie s-triazyn i 4-hydroksypirymidyny (Stoks i Schwartz, 1981; Van der Velden i Schwartz, 1977). Późniejsze badania ekstraktów kwasu mrówkowego pozwoliły zidentyfikować kilka puryn, w tym adeninę, guaninę, hipoksantynę, ksantynę i pirymidynę uracyl w meteorytach CM2 Murchison i Murray oraz CI1 Orgueil (Stoks i Schwartz, 1981; Van der Velden i Schwartz, 1977), o łącznym występowaniu około 1 części na milion. Hipoksantyna i ksantyna nie są obecne w DNA lub RNA, ale są ważnymi produktami pośrednimi w syntezie i rozkładzie nukleotydów purynowych. Inne N-heterocykle wykryte w Murchisonie to 2,4,6-trimetylopirydyna, chinoliny i izochinoliny (Krishnamurthy i in., 1992; Stoks i Schwartz, 1982). Shimoyama et al. (1990) wykryli również guaninę oraz prawdopodobnie ksantynę i hipoksantynę w antarktycznych meteorytach CM Yamato (Y-) 74662 i Y-791198. W meteorycie CV3 Allende nie znaleziono żadnych nukleobaz (Stoks i Schwartz, 1981).
Ponieważ wiele N-heterocykli występuje na Ziemi, a nukleobazy wykryte w meteorytach są powszechne w biologii, nie można wykluczyć ich ziemskiego pochodzenia (Van Der Velden i Schwartz, 1974). W przeciwieństwie do aminokwasów, nukleobazy nie wykazują chiralności molekularnej, co utrudnia rozróżnienie pomiędzy abiotycznym i biotycznym pochodzeniem tych związków. Niemniej jednak, Van der Velden i Schwartz (1977) zauważyli, że duże ilości ksantyny i pozorny brak pirymidyn cytozyny i tyminy w meteorycie Murchison nie zgadzają się z rozmieszczeniem nukleobaz występujących w osadach lądowych, co przemawia za pozaziemskim pochodzeniem przynajmniej niektórych z tych związków. Pomiary izotopowe wykazały, że uracyl (δ13C = +44,5‰) i ksantyna (δ13C = +37,7‰) w meteorycie Murchisona wykazały wzbogacenie izotopu 13C w porównaniu z uracylem wyekstrahowanym z gleby w miejscu upadku Murchisona (δ13C = -10,6‰), co sugeruje, że uracyl i ksantyna w Murchisonie są pochodzenia pozaziemskiego (Martins i in., 2008). Jednakże, analizy te nie miały podstawowej separacji od zanieczyszczeń tła, a obecność koelucjonujących kwasów karboksylowych wzbogaconych w 13C w Murchison mogła przyczynić się do wartości δ13C zmierzonych dla uracylu i ksantyny, więc wartości te nie są jednoznaczne (Burton i in., 2012b). Dodatkowe pomiary byłyby ostatecznie konieczne, aby zdecydowanie ustalić pozaziemskie pochodzenie dla tych i innych N-heterocykli wykrytych w meteorytach węglowych.
Rozległa kampania poszukiwania i określania obfitości i dystrybucji puryn i pirymidyn w ekstraktach kwasu mrówkowego z 11 różnych CI, CM i CR CC została podjęta przez Callahan i wsp. (2011). Zastosowali oni nową, jednorazową technikę ekstrakcji do fazy stałej po ekstrakcji meteorytów kwasem mrówkowym, aby poprawić wydajność odzyskiwania N-heterocykli i znacznie ograniczyć obecność przeszkadzających kwasów karboksylowych oraz zanieczyszczeń pochodzących z wieloetapowych procesów oczyszczania stosowanych w poprzednich badaniach (Callahan i in., 2011). Ostatnie postępy w spektrometrii mas i technikach analitycznych umożliwiły jednoznaczną identyfikację i kwantyfikację nukleobaz w złożonych mieszaninach. Callahan i wsp. użyli kombinacji chromatografii cieczowej sprzężonej z potrójnym kwadrupolem spektrometru mas do identyfikacji nukleobaz na podstawie charakterystycznych dla każdego związku przejść jonów z rodzica na córkę oraz chromatograficznych czasów retencji. Dodatkowo, przy użyciu spektrometru masowego Fourier Transform Orbitrap uzyskano bardzo czyste widma mas o ultra wysokiej rozdzielczości, co pozwoliło na jednoznaczne przypisanie wzoru pierwiastkowego dla każdego związku. Stosując te dwie techniki analityczne, stwierdzono, że meteoryt Murchison i dwa antarktyczne meteoryty CM2 LON 94102 i LEW 90500 zawierają bardzo zróżnicowany zestaw nukleobaz, w tym adeninę, guaninę, hipoksantynę i ksantynę oraz trzy niezwykłe i ziemsko rzadkie analogi nukleobaz: purynę, 6,8-diaminopurynę i 2,6-diaminopurynę (Callahan i in., 2011). Zgodne rozmieszczenie puryn w kilku różnych chondrytach CM2, które różniły się od biologii lądowej, dostarczyło najbardziej przekonujących dowodów na obecność pozaziemskich puryn w CCs. Meteoryty CM2 analizowane w badaniach Callahana i in. miały najobfitszy i najbardziej zróżnicowany zestaw puryn spośród badanych CC (o stężeniach od ∼1 do 244 ppb (Tabela 3.6). W bardziej zmienionych wodnie chondrytach typu 1 CI, CM i CR zaobserwowano spadek ogólnej obfitości i różnorodności nukleobaz. Eksperymenty laboratoryjne w ramach tych samych badań wykazały, że identyczny zestaw nukleobaz i analogów nukleobaz powstał w wodnych reakcjach cyjanku amonu, co uprawdopodobnia mechanizm ich powstawania w ciałach macierzystych asteroid (Callahan i in., 2011).
Tabela 3.6. Stężenie puryn (ppb) w chondrytach węglanowych
Meteoryt | Typ | G | HX | X | A | Pu | 2,6-DAPu | 6,8-DAPu |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Orgueil | CI1 | 20 | 5 | <10 | 7 | 5 | <2 | – |
SCO 06043 | CM1 | 2 | 4 | <10 | 4 | <1 | <2 | – |
MET 01070 | CM1 | 29 | <3 | <10 | 5 | <1 | <2 | – |
GRO 95577 | CR1 | <2 | <3 | <10 | <0.5 | <1 | <2 | – |
ALH 83100 | CM1/2 | 21 | 4 | 4 | 1 | <0.1 | <0.2 | + |
Murchison | CM2 | 56 | 26 | 60 | 5 | 3 | + | + |
LEW 90500 | CM2 | 167 | 23 | 22 | 10 | 1 | <0.2 | + |
LON 94102 | CM2 | 244 | 94 | 77 | 30 | 6 | 5 | + |
GRA 95229 | CR2 | 4 | 4 | <10 | 21 | 9 | <2 | + |
EET 92042 | CR2 | <2 | <3 | <10 | 5 | 4 | <2 | + |
QUE 99177 | CR3 | <2 | <3 | <10 | 11 | 7 | <2 | + |
2,6-DAPu, 2,6-diaminopuryna; 6,8-DAPu, 6,8-diaminopuryna; A, adenina; G, guanina; HX, hipoksantyna; Pu, puryna. Stężenia zostały określone na podstawie chromatogramu spektrometru masowego monitorującego reakcje wielokrotne potrójnego kwadrupolu i przedstawiają sumę wszystkich frakcji ekstrakcji fazy stałej. Puryny, które nie zostały wykryte, są zgłaszane jako górne granice lub ze znakiem ujemnym. Znak + wskazuje na pozytywne wykrycie związku bez oznaczenia ilościowego. 6,8-diaminopuryna nie została oznaczona ilościowo ze względu na brak czystego standardu.
Zmodyfikowano z Callahan, M.P., Smith, K.E., Cleaves II, H.J., Ruzicka, J., Stern, J.C., Glavin, D.P., House, C.H., Dworkin, J.P., 2011. Carbonaceous meteorites contain a wide range of extraterrestrial nucleobases. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 108, 13995-13998.
Powszechnie przyjmuje się, że pozaziemskie nukleobazy mogły powstać w wyniku abiotycznych mechanizmów reakcji w różnych środowiskach kosmicznych. Jednak niska szybkość powstawania w połączeniu z niską stabilnością wobec promieniowania UV sprawia, że wykrycie nukleobaz w ośrodku międzygwiazdowym i okołogwiazdowym jest niezwykle trudne (Peeters i in., 2003). W rzeczywistości, w ISM wykryto jedynie górne granice tej klasy związków (Kuan i in., 2003). Bardziej prawdopodobne jest, że za obecność meteorytowych nukleobaz odpowiedzialne są procesy syntetyczne zachodzące w ciele macierzystym meteorytu podczas jego wodnej przebudowy. W symulacjach laboratoryjnych zbadano szereg abiotycznych dróg syntezy. Obejmują one (1) polimeryzację HCN (Ferris et al., 1978; Levy et al., 1999; Minard et al., 1998; Miyakawa et al., 2002; Oro, 1960, 1961; Oro i Kimball, 1961; Sanchez et al., 1967; Voet i Schwartz, 1983), (2) synteza przez wygaszanie plazmy wysokotemperaturowej CON2H2O (Miyakawa i in., 2000), (3) reakcja cyjanoacetylenu z cyjanianem we względnie rozcieńczonym roztworze przy pH 8 i temperaturze pokojowej (Ferris et al., 1968), oraz (4) reakcja cyjanoacetaldehydu z mocznikiem w roztworze eutektycznym (Nelson et al., 2001) lub w wyższej temperaturze (Robertson i Miller, 1995). Możliwe są też inne drogi (Ferris i Hagan, 1984; Orgel, 2004), a kilka z nich mogło wystąpić na ciele macierzystym meteorytu Murchison. Należy również wziąć pod uwagę degradację nukleobaz w uwodnionym środowisku ciała macierzystego podczas wodnej fazy przeobrażenia. Na przykład, cytozyna ulega degradacji do uracylu z okresem półtrwania 17 000 lat, a guanina rozkłada się do ksantyny z okresem półtrwania 1,3 Ma w temperaturze 0°C i pH 7 (Levy i Miller, 1998). W związku z tym obserwowany rozkład meteorytowych nukleobaz jest wynikiem zarówno reakcji syntetycznych, jak i późniejszej degradacji.
Monokarboksylowe heterocykle: kwas nikotynowy, kwas pikolinowy i kwas izonikotynowy zostały zidentyfikowane w niezgrupowanym CC z jeziora Tagish C2 i w dziewięciu różnych CC CM2: Murchison, LEW 85311, LAP 02336, LAP 02333, EET 96016, ALH 85013, DOM 08003, DOM 03183 i WIS 91600 (Alexandre i in.., 2004; Huang et al., 2005; Pizzarello et al., 2001; Pizzarello i Huang, 2002; Smith et al., 2014b) z wartościami stosunku izotopów specyficznych dla danego związku dla kwasu nikotynowego w zakresie pozaziemskim (δD = +129‰ i δ13C = +20‰) w meteorycie Murchison (Huang et al., 2004; Pizzarello et al., 2004). Wspólne laboratoryjne kosmochemiczne syntezy tych kwasów monokarboksylowych pirydyny z napromieniowania protonami lodu 20K pirydyna/CO2 wykazały taki sam stosunek tych trzech gatunków, jaki zaobserwowano w meteorytach CM2 (Smith i in., 2014a) oraz że chociaż względne proporcje tych trzech gatunków były podobne, to ich obfitość była odwrotnie proporcjonalna do historii przeobrażeń wodnych. Zaobserwowano również inne funkcjonalizowane heterocykle azotowe. Ostatnio, za pomocą spektrometrii mas o ultra wysokiej rozdzielczości, wykryto w meteorycie Murchison zestaw alkilowanych pirydyn (Yamashita i Naraoka, 2014). Kilka innych heterocykli azotowych, takich jak skondensowane kwasy ftalowy i homoftalowy, chinolony i inne metylowane pirydiny monokarboksylowe, wykryto w Murchisonie (Pizzarello i in., 2006).